基因组调控中心(CRG)的研究人员启动了一个新的数据库，以推进研究COVID-19的国际研究工作。
这个公开、免费的资源(https://covid.crg.eu)可供世界各地的研究人员使用，以研究病毒的不同变种如何生长、变异和制造蛋白质。
“科学家们正在夜以继日地工作，以了解导致COVID-19的病毒SARS-CoV-2，以便我们能够找到它的弱点并击败它。世界各地正在发表大量的科学数据，”巴塞罗那CRG的研究员Eva Novoa说。
“然而，我们用于研究SARS-CoV-2的一些技术，如纳米孔RNA测序，是如此的新，以至于一篇论文的结果与另一篇论文的结果无法相比，因为使用了不同的标准和方法。我们正在收集所有这些数据并对其进行分析，以使其符合更普遍可比较的标准。这将有助于研究人员更快、更准确地发现冠状病毒的优缺点。”
为了了解冠状病毒如何生长、变异和复制，科学家们必须对COVID-19的RNA进行测序。RNA序列揭示了病毒制造的蛋白质的关键信息，这些蛋白质可以侵入人体细胞并进行复制，从而向各国政府通报疫情的传染性和严重性。
传统的测序工具可能需要很长时间才能提供结果。近年来，由于纳米孔测序技术的使用，基因组学研究和疾病爆发监测的革命性变化，实时测序数据已成为现实。纳米孔测序使科学家和临床医生能够即时获取任何活细胞的DNA和RNA序列信息，从而能够对大流行的威胁作出快速反应。
然而，纳米孔测序产生的原始数据是高度复杂的。科学家和临床医生目前缺乏对数据进行可重复分析的系统指导方针，限制了这项新生技术的巨大潜力。
为了使公开获得的SARS-CoV-2纳米孔测序数据的分析标准化，巴塞罗那基因组调控中心(CRG)的研究人员正在使用masterof孔隙，这是Eva Novoa小组和CRG生物信息学部门开发的一个计算机程序。该软件于上周在《遗传学前沿》上首次被描述。
masterof毛孔可以在计算机，集群或云上的任何unix兼容的操作系统上执行，而无需安装任何额外的软件或依赖项，并且在Github中免费提供。这一公开、免费使用的资源目前分析了3TB的SARS-CoV-2纳米孔RNA测序数据。CRG的研究人员将在资源可用时继续用新数据更新资源。
